某科学的超电磁炮漫画:本作与本篇不同,是以御坂美琴为主角的漫画。此外,爱慕美琴的白井黑子也是主角之一。故事发生在面积占据东京都的三分之一,居住着230万名人口,其中八成人口是学生的巨大都市。学院都市和外部隔离,研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发,并大都借由药物、催眠术与通电刺激等等方式取得超能力。有各种类型不同能力,以范围和威力分为无能力者(LV0)、低能力者(LV1)、异能力者(LV2)、强能力者(LV3)、大能力者(LV4)、超能力者(LV5)。每隔一定时间会进行身体检查,重新测定一次。女主角御坂美琴是就读于学园都市名门贵族女校“常盘台中学”的十四岁少女。在学园都市中只有七人的等级五超能力者排行第三。拥有操纵电击的能力,因此被称为“电击使”。本作不但通过美琴的视角来描绘学园城市的日常生活,也叙述了学园城市秘密进行地有非人道性质的关于“妹妹们”(Sisters)的实验,从而使大家对于本作及本篇魔法禁书目录的背景(世界观)的认识也慢慢变得清楚